Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms