Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-1B6SEH8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms