Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NOTOA8MTQ0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms