Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SNX8Q9Y5X2 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SNX8Q9Y5X2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SNX8Q9Y5X2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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SNX8Q9Y5X2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SNX8Q9Y5X2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SNX8Q9Y5X2 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SNX8Q9Y5X2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SNX8Q9Y5X2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNX8Q9Y5X2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNX8Q9Y5X2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNX8Q9Y5X2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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