Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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