Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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USP20Q9Y2K6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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USP20Q9Y2K6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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USP20Q9Y2K6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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