Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms