Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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