Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms