Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MIS18AQ9NYP9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms