Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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