Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms