Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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