Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms