Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms