Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms