Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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UPK3BQ9BT76 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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UPK3BQ9BT76 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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UPK3BQ9BT76 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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UPK3BQ9BT76 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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UPK3BQ9BT76 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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