Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms