Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms