Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256 ms