Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXNL1Q96CM4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms