Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAVIN3Q969G5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms