Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms