Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms