Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE1Q8WV22 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms