Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SEMA6DQ8NFY4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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