Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB43Q86YS6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB43Q86YS6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB43Q86YS6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB43Q86YS6 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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