Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms