Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q71RC1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q71RC1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms