Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms