Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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