Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L6Q3SYB3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms