Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PTPRNQ16849 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PTPRNQ16849 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PTPRNQ16849 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PTPRNQ16849 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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PTPRNQ16849 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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