Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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