Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCAQ16586 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms