Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms