Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
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SCN9AQ15858 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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SCN9AQ15858 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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SCN9AQ15858 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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SCN9AQ15858 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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SCN9AQ15858 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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SCN9AQ15858 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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SCN9AQ15858 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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SCN9AQ15858 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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SCN9AQ15858 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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SCN9AQ15858 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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SCN9AQ15858 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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SCN9AQ15858 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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SCN9AQ15858 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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