Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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