Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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