Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms