Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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PDK2Q15119 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PDK2Q15119 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PDK2Q15119 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PDK2Q15119 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PDK2Q15119 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PDK2Q15119 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PDK2Q15119 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PDK2Q15119 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PDK2Q15119 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PDK2Q15119 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PDK2Q15119 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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PDK2Q15119 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PDK2Q15119 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK2Q15119 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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