Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCOLCEQ15113 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms