Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms