Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms