Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms