Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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