Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms