Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms