Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CALCOCO2Q13137 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CALCOCO2Q13137 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CALCOCO2Q13137 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CALCOCO2Q13137 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CALCOCO2Q13137 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CALCOCO2Q13137 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CALCOCO2Q13137 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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