Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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IFT88Q13099 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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IFT88Q13099 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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IFT88Q13099 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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IFT88Q13099 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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IFT88Q13099 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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IFT88Q13099 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT88Q13099 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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